BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 flashcards    chomikmimi
mp3 indir Baskı oynamak kendini kontrol et
 
soru język polski cevap język polski
Białka, światło?
öğrenmeye başla
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
öğrenmeye başla
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
öğrenmeye başla
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
öğrenmeye başla
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
öğrenmeye başla
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
öğrenmeye başla
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
öğrenmeye başla
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
öğrenmeye başla
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
öğrenmeye başla
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
öğrenmeye başla
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
öğrenmeye başla
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
öğrenmeye başla
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
öğrenmeye başla
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
öğrenmeye başla
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
öğrenmeye başla
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
öğrenmeye başla
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
öğrenmeye başla
Roślin
Biblioteki DNA
öğrenmeye başla
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
öğrenmeye başla
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
öğrenmeye başla
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
öğrenmeye başla
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
öğrenmeye başla
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
öğrenmeye başla
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
öğrenmeye başla
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
öğrenmeye başla
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
öğrenmeye başla
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
öğrenmeye başla
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
öğrenmeye başla
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
öğrenmeye başla
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
öğrenmeye başla
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
öğrenmeye başla
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
öğrenmeye başla
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
öğrenmeye başla
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
öğrenmeye başla
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
öğrenmeye başla
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
öğrenmeye başla
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
öğrenmeye başla
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
öğrenmeye başla
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
öğrenmeye başla
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
öğrenmeye başla
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
öğrenmeye başla
od warunków
Napięcie w elektroforezie
öğrenmeye başla
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
öğrenmeye başla
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
öğrenmeye başla
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
öğrenmeye başla
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
öğrenmeye başla
SYBR
cechy SYBR
öğrenmeye başla
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
öğrenmeye başla
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
öğrenmeye başla
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
öğrenmeye başla
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
öğrenmeye başla
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
öğrenmeye başla
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
öğrenmeye başla
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
öğrenmeye başla
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
öğrenmeye başla
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
öğrenmeye başla
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
öğrenmeye başla
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
öğrenmeye başla
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
öğrenmeye başla
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
öğrenmeye başla
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
öğrenmeye başla
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
öğrenmeye başla
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
öğrenmeye başla
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
öğrenmeye başla
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
öğrenmeye başla
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
öğrenmeye başla
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
öğrenmeye başla
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
öğrenmeye başla
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
öğrenmeye başla
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
öğrenmeye başla
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
öğrenmeye başla
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
öğrenmeye başla
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
öğrenmeye başla
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
öğrenmeye başla
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
öğrenmeye başla
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
öğrenmeye başla
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
öğrenmeye başla
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
öğrenmeye başla
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
öğrenmeye başla
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
öğrenmeye başla
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
öğrenmeye başla
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
öğrenmeye başla
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
öğrenmeye başla
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
öğrenmeye başla
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
öğrenmeye başla
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
öğrenmeye başla
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
öğrenmeye başla
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
öğrenmeye başla
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
öğrenmeye başla
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
öğrenmeye başla
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
öğrenmeye başla
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
öğrenmeye başla
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
öğrenmeye başla
Puryny i pirymidyny
Puryny
öğrenmeye başla
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
öğrenmeye başla
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
öğrenmeye başla
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
öğrenmeye başla
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
öğrenmeye başla
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
öğrenmeye başla
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
öğrenmeye başla
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
öğrenmeye başla
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
öğrenmeye başla
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
öğrenmeye başla
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
öğrenmeye başla
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
öğrenmeye başla
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
öğrenmeye başla
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
öğrenmeye başla
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
öğrenmeye başla
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
öğrenmeye başla
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
öğrenmeye başla
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
öğrenmeye başla
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
öğrenmeye başla
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
öğrenmeye başla
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
öğrenmeye başla
dla transferu białka
EASTERN BLOT
öğrenmeye başla
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
öğrenmeye başla
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
öğrenmeye başla
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
öğrenmeye başla
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
öğrenmeye başla
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
öğrenmeye başla
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
öğrenmeye başla
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
öğrenmeye başla
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
öğrenmeye başla
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
öğrenmeye başla
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
öğrenmeye başla
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
öğrenmeye başla
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
öğrenmeye başla
STS-PCR
RACE-PCR
öğrenmeye başla
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
öğrenmeye başla
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
öğrenmeye başla
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
öğrenmeye başla
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
öğrenmeye başla
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
öğrenmeye başla
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
öğrenmeye başla
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
öğrenmeye başla
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
öğrenmeye başla
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
öğrenmeye başla
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
öğrenmeye başla
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
öğrenmeye başla
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
öğrenmeye başla
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
öğrenmeye başla
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
öğrenmeye başla
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
öğrenmeye başla
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
öğrenmeye başla
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
öğrenmeye başla
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
öğrenmeye başla
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
öğrenmeye başla
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
öğrenmeye başla
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
öğrenmeye başla
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
öğrenmeye başla
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
öğrenmeye başla
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
öğrenmeye başla
southern
HGP
öğrenmeye başla
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
öğrenmeye başla
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
öğrenmeye başla
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
öğrenmeye başla
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
öğrenmeye başla
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
öğrenmeye başla
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
öğrenmeye başla
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
öğrenmeye başla
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
öğrenmeye başla
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
öğrenmeye başla
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
öğrenmeye başla
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
öğrenmeye başla
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
öğrenmeye başla
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
öğrenmeye başla
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
öğrenmeye başla
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
öğrenmeye başla
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
öğrenmeye başla
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
öğrenmeye başla
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
öğrenmeye başla
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Yorum yapmak için giriş yapmalısınız.